Las tratativas preliminares al establecimiento de las relaciones diplomáticas entre la Soberana Orden de Malta y el Uruguay fueron realizadas por un grupo encabezado por el Dr. Ignacio Zorrilla de San Martín ante el Presidente del Consejo Nacional de Gobierno, Dr. Washington Beltrán y el Consejero Dr. Alberto Abdala.

Uruguay formalizó el vínculo diplomático por Resolución del Consejo Nacional de Gobierno de 1 de abril de 1965. El Gran Magisterio de la Orden de Malta perfeccionó las relaciones diplomáticas con la designación del Emb. Dr. Manuel Río como enviado Extraordinario y Ministro Plenipotenciario en diciembre de 1965, presentando sus cartas credenciales el 4 de julio de 1966.

Los Consejeros y Encargados de Negocios a.i. que ha tenido la Misión en Uruguay han sido:

• Dr. Hugo Eguiluz Paullier (1965-1993)
• Ing. Bertrand Gruss (1993-1998)
• Sr. Pierre den Baas (2001-2003)
• Sr. Stanilas Lubomirski (2025-presente)

Al mismo tiempo del establecimiento de las relaciones diplomáticas con la Rep. O. del Uruguay, se creó también la Asociación Uruguaya de la Orden de Malta.

Desde un comienzo, tanto la Embajada como la Asociación Uruguaya, en coordinación con el Ministerio de Salud Pública del Uruguay, trabajaron para el combate a la enfermedad de Hansen (Lepra), erradicada definitivamente del país en la década de los ’90.

También la Embajada contribuyó con la restauración y equipamiento del Pequeño Cottolengo de Don Orione en Montevideo, en 1980.

En ese año a su vez se firma el Convenio Postal entre la Orden y Uruguay, firmado por el Embajador Umberto Ortolani y el Ministro (i.) de Relaciones Exteriores, Dr. Julio César Lupinacci.

Las actividades para destacar de la Embajada de la Orden en Uruguay han sido siempre el apoyo a la Asociación Uruguaya para la importación de ambulancias, medicamentos, material y equipamiento médico, principalmente para el Instituto Hanseniano y el Cottolengo de Don Orione.

En los años 90 se importaron 3 dispensarios odontológicos móviles, para la asistencia dentaria en zonas remotas de los departamentos de Paysandú, Tacuarembó y Rivera. Posteriormente en 2015 se destinó un 4to móvil, que funciona actualmente en el Municipio E de la ciudad de Montevideo, atendiendo a chicos de las escuelas públicas en la circunscripción del Gobierno local.

La Embajada, en coordinación con la Asociación Uruguaya, también ha importado recientemente 5 contenedores con equipamiento hospitalario, provenientes de Suiza, para el Hospital Regional de Salto, el Cottolengo de Don Orione y el Hogar Sacerdotal y de las Hermanas de la Hijas de María Auxiliadora.

En cuanto a su función política-representativa, siempre se organiza una recepción para celebrar el 24 de junio, Natividad de San Juan, su Santo Patrono, así como también exposiciones para festejar los años cumplidos de relaciones diplomáticas con Uruguay. En particular emisión de sello de correo en 2006 y exposición filatélica y numismática en 2016.

En nueva etapa ahora para la ampliación de la colaboración con el programa dentario, solicitado por los Hospitales de Salto y Paysandú.